Projekt rekonstrukce zahrnuje stavební a restaurátorskou obnovu konstrukcí celého obvodového pláště kostela a stavební a restaurátorskou obnovu vnitřních prostor jižní středověké věže, vložení chybějících podlahových konstrukcí věže a její následné zpřístupnění veřejnosti. Oblíbená vyhlídka bude upravena tak, aby se zabránilo dalším nešťastným událostem. Život skokem z věže tu totiž v nedávné minulosti ukončilo několik lidí. Vzniknout by také mělo muzeum varhanářství a expozice o chrámu sv. Mořice. Součástí oprav bude rozsáhlá rekonstrukce Englerových varhan, která by měla vyjít na desítky milionů korun. "11. března by mělo být ukončeno výběrové řízení. Poté budou posouzeny nabídky a bude jasné, kdo se této náročné rekonstrukce zhostí," prozradil regenschori chrámu sv. Mořice Karel Martínek. 

Veškeré opravy budou po celou dobu nepřetržitě zaznamenávány. Z těchto záznamů vzniknou krátké časosběrné dokumenty, které návštěvníci uvidí v budované expozici v prostorách jižní věže.

Celková hodnota rekonstrukcí je vyčíslena na 123 milionů korun, z dotačního programu bude poskytnuto 116,850 milionů, tedy 95 %. Farnost musí zajistit zbývající částku 6,150 milionů. Na tuto částku může přispět kdokoliv. "Děkuji za poskytnuté dotace Evropské unii, Ministerstvu pro místní rozvoj a také městu Olomouc, zaštiťujícímu program ITI. Jména dárců uchováme ve varhanách v 'Seznamu dárců'. Prosím o vaši štědrost a velkorysost v této velké opravě. Svůj dar můžete složit přímo na faře, nebo vložit i se jménem do určené pokladničky v kostele. Díky za jakýkoli finanční dar," uvedl František Hanáček, probošt u sv. Mořice. Více informací o možnosti finančních příspěvků naleznete zde.

Práce by měly být ukončeny v roce 2021. Provoz kostela není omezen, rekonstrukce se však dotkne Mezinárodního varhanního festivalu, který bude přesunut do jiných olomouckých kostelů.